医生不建议患者直接做二代试管主要是因为二代试管的精子并没有经过优胜劣汰，精子质是通过肉眼观察选出来的，质量不能保证，虽然二代试管成功率比较高，但其养成优秀胚胎的概率和妊娠率都比一代试管要低。其弊端主要体现在对卵子有损伤、流产率高、成本较高等方面，而且该技术主要针对的男性患者，一般男性精子达不到要求才会做二代试管。
二代试管技术主要适用于严重的少、弱、畸精子症、不可逆的梗阻性无精子症、生精功能障碍、免疫性不育、体外受精失败或受精率低、精子顶体异常等疾病的患者。下面是医生不建议直接做二代试管的原因和二代试管的弊端说明：
1、第二代试管婴儿是在第一代试管的基础上开展的，如果患者在一代试管可以做试管成功就说明男方患者不需要通过第二代试管来挑选精子，一代试管失败就表示精子的质量确实不能自主受精，这就需要二代试管的技术干预；
2、二代试管婴儿是人为注射到卵子里的，属于强制受精、在单精子注射的过程中可能会对精子内部结构造成少许损伤；
3、一代试管有优胜劣汰的过程，二代通过肉眼人为挑选精子，有些看似好的精子很有可能存在一定的缺陷（基因或染色体），可能会造成流产死胎，增加流产率。
二代试管的成本一般都比一代试管的高，而且妊娠率要比一代试管低，因此医生一般不建议直接做二代试管，二代试管的适应人群不一样，医生都是根据患者的具体情况来制定方案的。
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